{"id":4964,"date":"2021-10-04T09:16:09","date_gmt":"2021-10-04T08:16:09","guid":{"rendered":"https:\/\/wip.geomatys.com\/?p=4964"},"modified":"2024-12-12T11:31:13","modified_gmt":"2024-12-12T10:31:13","slug":"modelisation-de-la-distribution-des-especes-next-level","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.geomatys.com\/en\/2021\/10\/04\/modelisation-de-la-distribution-des-especes-next-level\/","title":{"rendered":"Mod\u00e9lisation de la distribution des esp\u00e8ces next-level"},"content":{"rendered":"<figure class=\"wp-block-post-featured-image\"><img data-recalc-dims=\"1\" fetchpriority=\"high\" decoding=\"async\" width=\"800\" height=\"533\" src=\"https:\/\/i0.wp.com\/www.geomatys.com\/wp-content\/uploads\/2022\/11\/image.png?resize=800%2C533&#038;ssl=1\" class=\"attachment-post-thumbnail size-post-thumbnail wp-post-image\" alt=\"\" style=\"object-fit:cover;\" srcset=\"https:\/\/i0.wp.com\/www.geomatys.com\/wp-content\/uploads\/2022\/11\/image.png?w=1050&amp;ssl=1 1050w, https:\/\/i0.wp.com\/www.geomatys.com\/wp-content\/uploads\/2022\/11\/image.png?resize=300%2C200&amp;ssl=1 300w, https:\/\/i0.wp.com\/www.geomatys.com\/wp-content\/uploads\/2022\/11\/image.png?resize=1024%2C683&amp;ssl=1 1024w, https:\/\/i0.wp.com\/www.geomatys.com\/wp-content\/uploads\/2022\/11\/image.png?resize=768%2C512&amp;ssl=1 768w\" sizes=\"(max-width: 800px) 100vw, 800px\" \/><\/figure>\n\n\n<p class=\"has-raft-bg-color has-text-color\"><a rel=\"noreferrer noopener\" href=\"https:\/\/en.wikipedia.org\/wiki\/Species_distribution_modelling\" target=\"_blank\">Les mod\u00e8les de r\u00e9partition des esp\u00e8ces (MDS)<\/a>&nbsp;sont des mod\u00e8les statistiques et m\u00e9canistes utilis\u00e9s pour d\u00e9finir la r\u00e9partition g\u00e9ospatiale des esp\u00e8ces en fonction de la combinaison de variables \u00e9cologiques (telles que l\u2019environnement biotique et abiotique) offrant des conditions et des possibilit\u00e9s favorisant leur pr\u00e9sence.<\/p>\n\n\n\n<p class=\"has-text-align-left has-raft-bg-color has-text-color\">En projetant les MDS sur des environnements futurs, les scientifiques peuvent d\u00e9terminer o\u00f9 et quand ces conditions seront r\u00e9unies pour fournir une pr\u00e9diction de la r\u00e9partition future des esp\u00e8ces. Ces pr\u00e9dictions sont souvent pr\u00e9vues des mois, des ann\u00e9es ou des d\u00e9cennies \u00e0 l\u2019avance, et sont statiques en ce qui concerne \u00e0 la fois l\u2019algorithme et les occurrences pr\u00e9dites.<\/p>\n\n\n\n<p class=\"has-raft-bg-color has-text-color\">Cependant, les facteurs qui affectent les esp\u00e8ces et leurs d\u00e9placements ne sont pas statiques.&nbsp;<strong>Imaginez que vous puissiez appliquer ces mod\u00e8les \u00e0 un monde en \u00e9volution en temps r\u00e9el !&nbsp;<\/strong>C\u2019est pr\u00e9cis\u00e9ment l\u2019aide que nous apportons aux scientifiques en utilisant la technologie de traitement g\u00e9ospatial et de science des donn\u00e9es \u00e0 la vol\u00e9e EXAMIND de Geomatys.&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p class=\"has-raft-bg-color has-text-color\">Lorsque les conditions environnementales changent, ou sont affect\u00e9es par des perturbations telles qu\u2019un ouragan ou des projets de d\u00e9veloppement qui perturbent les habitats actuels, des MDS \u00e0 \u00e9chelle fine peuvent \u00eatre appliqu\u00e9s pour pr\u00e9dire comment les animaux se disperseront. En collaboration avec nos partenaires de la recherche et de l\u2019industrie, nous travaillons \u00e0 l\u2019application de cette technologie en d\u00e9veloppement pour, par exemple, g\u00e9rer les populations animales.&nbsp;Cette capacit\u00e9 deviendra essentielle dans presque tous les domaines, y compris la gestion de la biodiversit\u00e9, car le changement climatique d\u00e9stabilise les \u00e9cosyst\u00e8mes et les habitudes, et ainsi il perturbe les connaissances sur lesquelles nous nous appuyons actuellement pour prendre des d\u00e9cisions.<\/p>\n\n\n\n<p class=\"has-raft-bg-color has-text-color\">Un projet dans lequel la technologie de&nbsp;<a rel=\"noreferrer noopener\" href=\"http:\/\/www.geomatys.com\/en\/\" target=\"_blank\">Geomatys<\/a>&nbsp;facilite ce travail est celui fait pour l\u2019association fran\u00e7aise pour la gestion et la conservation du cheval de Przewalski, une esp\u00e8ce menac\u00e9e (<a href=\"https:\/\/www.takh.org\/\" target=\"_blank\" rel=\"noreferrer noopener\">TAKH<\/a>). L\u2019association a pr\u00e9sent\u00e9 son portail Web aliment\u00e9 par&nbsp;<a href=\"https:\/\/www.geomatys.com\/en\/products\/\" target=\"_blank\" rel=\"noreferrer noopener\">EXAMIND<\/a>&nbsp;pour visualiser et analyser les populations de chevaux de Przewalski, appel\u00e9 Shamane, lors du&nbsp;<a href=\"https:\/\/www.iucncongress2020.org\/\" target=\"_blank\" rel=\"noreferrer noopener\">Congr\u00e8s mondial de la nature de l\u2019UICN de cette ann\u00e9e<\/a>, le 8 septembre 2021 \u00e0 Marseille.<\/p>\n\n\n\n<div class=\"wp-block-group is-layout-flow wp-block-group-is-layout-flow\">\n<figure class=\"wp-block-image size-full is-style-default\"><a href=\"https:\/\/takh.geomatys.com\"><img data-recalc-dims=\"1\" decoding=\"async\" width=\"569\" height=\"235\" src=\"https:\/\/i0.wp.com\/www.geomatys.com\/wp-content\/uploads\/2022\/11\/image-1.png?resize=569%2C235&#038;ssl=1\" alt=\"\" class=\"wp-image-13\" srcset=\"https:\/\/i0.wp.com\/www.geomatys.com\/wp-content\/uploads\/2022\/11\/image-1.png?w=569&amp;ssl=1 569w, https:\/\/i0.wp.com\/www.geomatys.com\/wp-content\/uploads\/2022\/11\/image-1.png?resize=300%2C124&amp;ssl=1 300w\" sizes=\"(max-width: 569px) 100vw, 569px\" \/><\/a><\/figure>\n<\/div>\n\n\n\n<p class=\"has-raft-bg-color has-text-color\">Explorer le platform Shamane (<a rel=\"noreferrer noopener\" href=\"https:\/\/takh.geomatys.com\/\" target=\"_blank\">https:\/\/takh.geomatys.com\/<\/a>)<\/p>\n\n\n\n<p class=\"has-raft-bg-color has-text-color\">Bien que l\u2019objectif soit de former des algorithmes d\u2019apprentissage automatique qui puissent aider \u00e0 pr\u00e9dire le comportement des chevaux en r\u00e9ponse \u00e0 des facteurs environnementaux variant dans le temps, un travail pr\u00e9liminaire que nous ayons effectu\u00e9 pour faciliter ce projet a \u00e9t\u00e9 de construire la base de donn\u00e9es, en rassemblant des sources de donn\u00e9es vastes et disparates, en assurant l\u2019interop\u00e9rabilit\u00e9 et en les rendant accessibles \u00e0 l\u2019utilisateur dans un seul environnement.&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p class=\"has-raft-bg-color has-text-color\">Gr\u00e2ce aux nouvelles fonctionnalit\u00e9s disponible sur son socle EXAMIND en r\u00e9ponse aux besoins des chercheurs TAKH, les utilisateurs peuvent suivre des animaux individuels \u00e0 travers le temps, basculer leur histoire et leur pedigree, explorer leurs habitats en 4D, interroger des ensembles de donn\u00e9es connexes et lancer des analyses, le tout dans l\u2019environnement de l\u2019infrastructure de donn\u00e9es spatiales de Shamane. L\u2019outil permet donc non seulement d\u2019analyser les donn\u00e9es, mais aussi de fournir des renseignements permettant de prendre des d\u00e9cisions en temps r\u00e9el en mati\u00e8re de surveillance et de gestion des populations.<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-video\"><video height=\"1080\" style=\"aspect-ratio: 1920 \/ 1080;\" width=\"1920\" controls src=\"https:\/\/www.geomatys.com\/wp-content\/uploads\/2022\/12\/Shamane_teaser_v06-1.mp4\"><\/video><\/figure>\n\n\n\n<p class=\"has-text-align-center has-raft-bg-color has-text-color\">Vid\u00e9o teaser cr\u00e9e pour le TAKH par Les F\u00e9es Sp\u00e9ciales<\/p>\n\n\n\n<p class=\"has-raft-bg-color has-text-color\">La vid\u00e9o teaser du projet Shamane ci-dessus illustre comment l\u2019utilisateur peut suivre le mouvement de chevaux individuels g\u00e9n\u00e9tiquement distincts (repr\u00e9sent\u00e9s par des couleurs diff\u00e9rentes, souvent regroup\u00e9s en troupeaux) dans une vue 3D du paysage. \u00c0 l\u2019aide du curseur situ\u00e9 en bas de la page, il peut suivre les changements de position des animaux ainsi que l\u2019\u00e9volution de l\u2019habitat dans le temps. Cela permet aux chercheurs de d\u00e9terminer, par exemple, quels types de barri\u00e8res d\u2019habitat peuvent influencer les d\u00e9placements.&nbsp;<\/p>\n\n\n\n<p class=\"has-raft-bg-color has-text-color\">Dans un prochain temps, ils vont pouvoir \u00e9galement superposer d\u2019autres donn\u00e9es, telles que des donn\u00e9es m\u00e9t\u00e9orologiques \u00e0 cette vue et effectuer des analyses dans la barre lat\u00e9rale de gauche \u00e0 l\u2019aide d\u2019un notebook de datascience. A priori, ces analyses visent \u00e0 identifier les facteurs \u00e9cologiques qui d\u00e9terminent les comportements de d\u00e9placement des animaux afin de soutenir les strat\u00e9gies de gestion des populations et d\u2019autres efforts de conservation.<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-embed is-type-video is-provider-youtube wp-block-embed-youtube wp-embed-aspect-16-9 wp-has-aspect-ratio\"><div class=\"wp-block-embed__wrapper\">\n<iframe title=\"Next-level species distribution modeling: Shamane from Geomatys\/TAKH\" width=\"800\" height=\"450\" src=\"https:\/\/www.youtube.com\/embed\/_qitMG8YBT4?start=1&#038;feature=oembed\" frameborder=\"0\" allow=\"accelerometer; autoplay; clipboard-write; encrypted-media; gyroscope; picture-in-picture; web-share\" referrerpolicy=\"strict-origin-when-cross-origin\" allowfullscreen><\/iframe>\n<\/div><figcaption class=\"wp-element-caption\">Le futur de l\u2019environnement interactif de visualisation de donn\u00e9es 4D de Shamane, aliment\u00e9 par EXAMIND.<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n<p class=\"has-raft-bg-color has-text-color\">Bien que l\u2019outil soit disponible via un portail web, l\u2019acc\u00e8s est limit\u00e9 aux utilisateurs autoris\u00e9s, s\u00e9curis\u00e9 avec la m\u00eame technologie que celle utilis\u00e9e par Geomatys dans le domaine de la d\u00e9fense. Ceci est important pour traiter des donn\u00e9es sensibles, telles que la localisation pr\u00e9cise d\u2019esp\u00e8ces menac\u00e9es. Cet outil fournit donc une plateforme performante et s\u00e9curis\u00e9e pour g\u00e9rer la conservation de ces populations fragiles.<\/p>","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Les mod\u00e8les de r\u00e9partition des esp\u00e8ces (MDS)&nbsp;sont des mod\u00e8les statistiques et m\u00e9canistes utilis\u00e9s pour d\u00e9finir la r\u00e9partition g\u00e9ospatiale des esp\u00e8ces en fonction de la combinaison de variables \u00e9cologiques (telles que l\u2019environnement biotique et abiotique) offrant des conditions et des possibilit\u00e9s favorisant leur pr\u00e9sence. En projetant les MDS sur des environnements futurs, les scientifiques peuvent d\u00e9terminer o\u00f9 et quand ces conditions seront r\u00e9unies pour fournir une pr\u00e9diction de la r\u00e9partition future des esp\u00e8ces. Ces pr\u00e9dictions sont souvent pr\u00e9vues des mois, des ann\u00e9es ou des d\u00e9cennies \u00e0 l\u2019avance, et sont statiques en ce qui concerne \u00e0 la fois l\u2019algorithme et les occurrences pr\u00e9dites. Cependant, les facteurs qui affectent les esp\u00e8ces et leurs d\u00e9placements ne sont pas statiques.&nbsp;Imaginez que vous puissiez appliquer ces mod\u00e8les \u00e0 un monde en \u00e9volution en temps r\u00e9el !&nbsp;C\u2019est pr\u00e9cis\u00e9ment l\u2019aide que nous apportons aux scientifiques en utilisant la technologie de traitement g\u00e9ospatial et de science des donn\u00e9es \u00e0 la vol\u00e9e EXAMIND de Geomatys.&nbsp; Lorsque les conditions environnementales changent, ou sont affect\u00e9es par des perturbations telles qu\u2019un ouragan ou des projets de d\u00e9veloppement qui perturbent les habitats actuels, des MDS \u00e0 \u00e9chelle fine peuvent \u00eatre appliqu\u00e9s pour pr\u00e9dire comment les animaux se disperseront. En collaboration avec nos partenaires de la recherche et de l\u2019industrie, nous travaillons \u00e0 l\u2019application de cette technologie en d\u00e9veloppement pour, par exemple, g\u00e9rer les populations animales.&nbsp;Cette capacit\u00e9 deviendra essentielle dans presque tous les domaines, y compris la gestion de la biodiversit\u00e9, car le changement climatique d\u00e9stabilise les \u00e9cosyst\u00e8mes et les habitudes, et ainsi il perturbe les connaissances sur lesquelles nous nous appuyons actuellement pour prendre des d\u00e9cisions. Un projet dans lequel la technologie de&nbsp;Geomatys&nbsp;facilite ce travail est celui fait pour l\u2019association fran\u00e7aise pour la gestion et la conservation du cheval de Przewalski, une esp\u00e8ce menac\u00e9e (TAKH). 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Cela permet aux chercheurs de d\u00e9terminer, par exemple, quels types de barri\u00e8res d\u2019habitat peuvent influencer les d\u00e9placements.&nbsp; Dans un prochain temps, ils vont pouvoir \u00e9galement superposer d\u2019autres donn\u00e9es, telles que des donn\u00e9es m\u00e9t\u00e9orologiques \u00e0 cette vue et effectuer des analyses dans la barre lat\u00e9rale de gauche \u00e0 l\u2019aide d\u2019un notebook de datascience. A priori, ces analyses visent \u00e0 identifier les facteurs \u00e9cologiques qui d\u00e9terminent les comportements de d\u00e9placement des animaux afin de soutenir les strat\u00e9gies de gestion des populations et d\u2019autres efforts de conservation. Bien que l\u2019outil soit disponible via un portail web, l\u2019acc\u00e8s est limit\u00e9 aux utilisateurs autoris\u00e9s, s\u00e9curis\u00e9 avec la m\u00eame technologie que celle utilis\u00e9e par Geomatys dans le domaine de la d\u00e9fense. 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